Refactored api.

.gitignore

.python-version

dependencies/parsers/all_test_files.zip

docs/setup.md

nomad/app/__init__.py

nomad/app/__main__.py

nomad/app/api/__init__.py

nomad/app/api/admin.py

nomad/app/api/api.py

nomad/app/api/archive.py

nomad/app/api/auth.py

nomad/app/api/common.py

nomad/app/api/info.py

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nomad/app/optimade/__init__.py

nomad/app/utils.py