diff --git a/Fst_calculation/fst.sh b/Fst_calculation/fst.sh
index 8b137891791fe96927ad78e64b0aad7bded08bdc..94eb38e78c24848fe688a4f012b1fb7ac2bbfa72 100644
--- a/Fst_calculation/fst.sh
+++ b/Fst_calculation/fst.sh
@@ -1 +1,15 @@
-
+vcftools --gzvcf concat_snps_less_miss.vcf.gz --weir-fst-pop grp1 --weir-fst-pop grp2 --out grp1_grp2
+vcftools --gzvcf concat_snps_less_miss.vcf.gz --weir-fst-pop grp1 --weir-fst-pop grp3 --out grp1_grp3
+vcftools --gzvcf concat_snps_less_miss.vcf.gz --weir-fst-pop grp1 --weir-fst-pop grp4 --out grp1_grp4
+vcftools --gzvcf concat_snps_less_miss.vcf.gz --weir-fst-pop grp1 --weir-fst-pop grp5 --out grp1_grp5
+vcftools --gzvcf concat_snps_less_miss.vcf.gz --weir-fst-pop grp1 --weir-fst-pop grp6 --out grp1_grp6
+vcftools --gzvcf concat_snps_less_miss.vcf.gz --weir-fst-pop grp2 --weir-fst-pop grp3 --out grp2_grp3
+vcftools --gzvcf concat_snps_less_miss.vcf.gz --weir-fst-pop grp2 --weir-fst-pop grp4 --out grp2_grp4
+vcftools --gzvcf concat_snps_less_miss.vcf.gz --weir-fst-pop grp2 --weir-fst-pop grp5 --out grp2_grp5
+vcftools --gzvcf concat_snps_less_miss.vcf.gz --weir-fst-pop grp2 --weir-fst-pop grp6 --out grp2_grp6
+vcftools --gzvcf concat_snps_less_miss.vcf.gz --weir-fst-pop grp3 --weir-fst-pop grp4 --out grp3_grp4
+vcftools --gzvcf concat_snps_less_miss.vcf.gz --weir-fst-pop grp3 --weir-fst-pop grp5 --out grp3_grp5
+vcftools --gzvcf concat_snps_less_miss.vcf.gz --weir-fst-pop grp3 --weir-fst-pop grp6 --out grp3_grp6
+vcftools --gzvcf concat_snps_less_miss.vcf.gz --weir-fst-pop grp4 --weir-fst-pop grp5 --out grp4_grp5
+vcftools --gzvcf concat_snps_less_miss.vcf.gz --weir-fst-pop grp4 --weir-fst-pop grp6 --out grp4_grp6
+vcftools --gzvcf concat_snps_less_miss.vcf.gz --weir-fst-pop grp5 --weir-fst-pop grp6 --out grp5_grp6